牙菌斑就是指黏附在牙齒周圍的細菌群落。口腔內的細菌很容易會黏附在牙齒表面，若不刷牙或沒有將這些細菌清除，細菌將隨著時間的拉長而大量增生，就會在牙面上、牙縫間，又特別是接近牙齦邊緣處形成不規則形狀的透明、半透明或白色的鬆軟黏膜，通稱為牙菌斑。有研究指出，1毫克的細菌含有多達兩億個細菌，而細菌的種類也可多達兩三百種。牙菌斑就是引起嘲齒及牙周病的罪魁禍首。初期形成的牙菌斑，不容易被發現，一般我們可以使用顯示劑來檢査牙菌斑。先將顯示劑塗抹在牙齒表面後，漱口去除多餘的染料，被顯示劑染上顏色的地方就是牙菌斑。
牙菌斑可以用牙刷、牙線及牙間刷等潔牙工具將它清除。要注意的是，牙菌斑在形成十多個小時後，會在唾液的共同作用下，逐漸鈣化，最後形成又黏又硬的牙石，通常牙石形成後，就不容易自行用牙刷等潔牙工具將它去除。
另外，牙石的顏色，一般比牙菌斑偏黃一些，但也有茶褐色甚至黑色的，因形成的時間長短、個人的飲食(喝咖啡、茶)及不良習慣(抽煙、嚼檳榔)等，而出現不同的顏色。
牙菌斑的一些細菌會分泌酸質而引起蛀牙；而牙結石和牙菌斑中的細菌毒素能誘使牙齦發炎。牙石一旦形成，新的牙菌斑會更容易附在結石上，若牙結石已深入牙齦下，會更方便厭氧菌的生長，而使牙周病更加惡化。
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